2011年7月28日，我所张宏实验室在《Developmental 购宝钱包 》杂志上在线发表题为“The WD40 Repeat PtdIns(3)P-Binding Protein EPG-6 Regulates Progression of Omegasomes to Autophagosomes ”的文章。该文章报道了线虫中的PI3P结合蛋白EPG-6在自体吞噬（autophagy）过程中发挥着重要作用。

细胞自噬过程是一种从酵母到哺乳动物都高度保守的过程，在生物体生长发育，应对环境胁迫等方面发挥重要作用。细胞自噬的一个基本特征是形成双层膜的自噬小体(autophagosome)，包裹被降解的蛋白复合体以及损伤细胞器等，最终与溶酶体融合。到现在为止鉴定的很多自噬相关基因都是参与自噬小体形成的分子过程，包括自噬小体前体结构的形成，膜泡的扩增及闭合等过程直至形成成熟的自噬小体。现在认为一种形成于ER的PI3P富集的称为Ω小体的结构在自噬小体的形成过程中发挥重要作用。自噬通路上游PI3K复合体产生P13P，募集下游PI3P结合蛋白，例如DFCP-1和ATG-18等。

本研究利用线虫作为遗传筛选模型鉴定了线虫中PI3P结合蛋白EPG-6参与了细胞自噬过程。EPG-6直接与ATG-2相互作用，共同调节Ω小体向自噬小体发育，在epg-6和atg-2突变体中，细胞内会聚集大量自噬小体前体结构。我们发现EPG-6更接近与哺乳动物中的WIPI4，而线虫中另外一个PI3P结合蛋白ATG-18更接近于哺乳动物中的WIPI1，epg-6与atg-18在自噬小体形成的不同阶段发挥作用。

顺利获得遗传分析我们建立了线虫中自噬基因发挥作用的上下游通路，并且发现ULK1，EPG-8/ATG-14以及LGG-1与蛋白聚集体的集合都是Ω小体形成所必须的。本研究发现不同的PI3P结合蛋白在自噬过程中发挥不同的功能，并且建立一个为分析蛋白聚集体降解过程的框架。