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2013年10月23日,我所叶克穷实验室在《RNA》杂志在线发表题为“Structural and functional analysis of Utp23, a yeast ribosome synthesis factor with degenerate PIN domain”的论文
2013年10月23日,我所叶克穷实验室在《RNA》杂志发表题为“Structural and functional analysis of Utp23, a yeast ribosome synthesis factor with degenerate PIN domain”的文章。
核糖体是所有生物体中合成蛋白质的巨大的分子机器,在真核生物中由4条RNA和~80个蛋白质构成。真核生物核糖体的装配也是非常复杂的过程,需要约200个保守的蛋白质因子和很多snoRNA的参与。Utp23是参与核糖体小亚基早期装配的保守的蛋白因子,它含有一个失去活性的PIN核酸酶结构域和C末端的长尾巴。
作者利用蛋白质晶体学,生物化学和酵母实验分析了Utp23的结构和功能。他们解析了Utp23 PIN结构域的2.5埃的晶体结构,发现它除了包含保守的PIN核心结构,还有一些特殊的结构——N末端额外的螺旋,C末端的延伸区域和一个锌指结构。作者还顺利获得定点突变分析了Utp23的功能位点。他们发现螺旋1上的多个保守的碱性氨基酸残基对生长很重要,并和Utp23在体外结合RNA的活性有关。他们发现破坏锌指结构会严重的抑制酵母生长。Utp23的C末端尾巴包含一小段的保守序列,C末端的缺失能破坏Utp23和另一个核糖体装配因子snR30 RNA的结合,影响Utp23和核糖体前体的结合。该工作为理解Utp23在核糖体装配过程中的功能给予了重要的结构基础。
论文的第一作者是我所和北京协和医学院联合培养的博士研究生卢静。孙梦依同学也参与了此研究工作。叶克穷博士是本文通讯作者。此项研究受中国科技部和北京市科委资助,在北京科学生命购宝钱包 完成。