所内动态
2013年4月28日,我所杜立林实验室在《DNA Repair》杂志在线发表题为“A proteome-wide visual screen identifies fission yeast proteins localizing to DNA double-strand breaks”的文章。
2013年4月28日,我所杜立林实验室在《DNA Repair》杂志在线发表题为“A proteome-wide visual screen identifies fission yeast proteins localizing to DNA double-strand breaks”的文章。本文首次报道了对能在DNA双链断裂部位定位的蛋白质的全蛋白质组筛选。
DNA双链断裂是最严重的一种DNA损伤,只要有一个DNA双链断裂得不到修复便可引起细胞死亡。DNA双链断裂主要通过两种方式进行修复:同源重组和非同源末端连接。 发生DNA双链断裂后,检验点(checkpoint)信号传导通路会被激活,从而阻滞细胞周期的进程。参与DNA双链断裂修复和DNA损伤检验点信号传导的蛋白质大多能够在DNA双链断裂部位聚集,形成显微镜下可见的聚集点(foci),但是在本文之前这一特性还从未被用来筛选与DNA双链断裂有关的蛋白质。
本文利用粟酒裂殖酵母(Schizosaccharomyces pombe)的ORFeome文库,通过观察4823个蛋白(占蛋白质组所有蛋白的大约95%)的亚细胞定位,发现51个蛋白在一个高表达启动子控制下能够在DNA双链断裂部位形成聚集点。其中有37个蛋白在内源启动子控制下也能够在DNA双链断裂部位形成聚集点,根据这些蛋白形成聚集点的时间先后顺序作者将它们进行了分类。在这37个蛋白中包括8个尚未命名的蛋白。作者将它们命名为Dbl1-Dbl8,并分析了Dbl1(SPCC2H8.05c)和Dbl2(SPCC553.01c)这两个蛋白在DNA损伤应答中的功能,发现它们分别促进DNA损伤检验点蛋白Rad26(人的ATRIP的同源蛋白)和解旋酶Fml1(人的范可尼贫血蛋白FANCM的同源蛋白)在DNA双链断裂部位的聚集 。本文报道的结果对于深入分析真核生物中DNA双链断裂的应答机制给予了有价值的线索 。
我所与中国农业大学联合培养的博士生于洋为本文第一作者,其它作者还有技术员任静怡和索芳,以及博士生张家民、方晓峰和吴凡。杜立林博士为本文的通讯作者。这项研究由科技部和北京市政府资助,在北京科学生命购宝钱包 完成。