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我所何新建实验室与中科院上海植物逆境生物学研究中心朱健康实验室合作在《Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America》发表题为“DTF1 is a core component of RNA-directed DNA methylation and may assist in the recruitment of Pol IV”的文章。

发布时间:2014/11/25

我所何新建实验室与中科院上海植物逆境生物学研究中心朱健康实验室合作在《Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America》发表题为“DTF1 is a core component of RNA-directed DNA methylation and may assist in the recruitment of Pol IV”的文章。

DNA甲基化是一种重要的染色质修饰方式。在植物体中,DNA甲基化的建立可以顺利获得RNA介导的DNA甲基化(RdDM)途径实现。其中DNA依赖的RNA聚合酶IV负责24-ntRNA的产生。以前的研究表明,DTF1/SHH1能够与RNA聚合酶IV结合,但是它在RdDM途径中作用的具体机制还不清楚。我们的研究表明,在RdDM的绝大多数靶标位点上,DTF1不仅是RNA聚合酶IV产生小RNA所必需的,而且是DNA甲基化的建立所必需的。DTF1可以和染色质重塑蛋白CLSY1在体内相互作用,并且共同结合到RNA聚合酶IV上。DTF1和它的同源蛋白DTF2可以顺利获得它们的SAWADEE区域结合到H3K9位置甲基化的组蛋白上。我们的研究表明,DTF1可能顺利获得招募RNA聚合酶IVRdDM的靶标位点来实现它的功能,而组蛋白H3K9的甲基化是这类RdDM靶标位点的重要特征。

本文的共同第一作者是张蘅(朱健康实验室)和马泽阳(何新建实验室),北京科学生命购宝钱包 参与本研究的其他人员还包括何新建实验室的张翠军、张素维,刘章伟以及核酸测序中心的蔡涛。参与本研究的还包括中科院上海植物逆境生物学研究中心朱健康实验室的其他成员;德克萨斯大学MD安德森癌症中心的Xiaobing ShiKaori Tanaka和加州大学河滨分校的Renyi Liu。中科院上海植物逆境生物学研究中心的朱健康博士和北京科学生命购宝钱包 的何新建博士是本研究的共同通讯作者。在北京科学生命购宝钱包 的工作得到科技部和北京市政府的资助。